Pada tahun 2019 Fakultas Pertanian mengalami penambahan program studi baru yaitu program studi Pengelolaan Sumber Daya Perairan sesuai dengan SK Kemenristekdikti Nomor 539/KPT/I/2019 tanggal 11 Juli 2019. Pembukaan Program Studi Pengelolaan Sumberdaya Perairan berdasarkan pertimbangan bahwa potensi yang dimiliki Sulawesi Tenggara khususnya pulau Buton yang merupakan daerah kepulauan dengan jumlah masyarakat yang tinggal diwilayah pesisir cukup besar. Perikanan merupakan salah satu komoditas unggulan, baik perikanan darat maupun laut yang didukung dengan tersedianya dosen-dosen yang kompeten di bidang perikanan.